本中心主要针对传统发酵工程领域和生物催化领域中的关键科学技术与工程问题。一方面，在传统工艺的基础上，利用现代发酵工程、酶工程、基因工程以及蛋白质组学技术，研究白酒、黄酒、葡萄酒、啤酒、果露酒中的特征风味成分和酿制过程中的功能微生物、酶及其代谢机制，开发新产品，提升传统工艺；另一方面，在分子水平改造重要微生物和酶，开发酶制剂，研究催化反应机制，提高反应效率，促进工业化应用。

本中心承担了不同层次的研究项目，包括国家重点基础研究发展计划(973)项目、国家高技术研究发展计划(863)项目、长江学者和创新团队发展计划、国家科技攻关重点项目、国家“十五”攻关项目、十一五支撑计划、国家自然科学基金项目、国家星火计划项目等国家级和江苏省”十五”工业攻关项目、教育部优秀青年教师资助项目、教育部高等学校骨干教师资助项目、江苏省火炬计划项目、江苏省高技术研究计划项目、教育部新世纪优秀人才支持计划等省部级科研项目。

本中心广泛参与国内外学术交流，主办和参与多个研修班和学术研讨班，与国外著名大学的专家学者进行互访和合作研究，并与国内知名企业建立良好合作关系，多项科研成果成功地实现了产业化。

部分研究室网站链接：酿造微生物学及应用酶学研究室